Les isoenzymes sont des enzymes qui catalysent la même réaction, mais qui diffèrent par leur séquence d'acides aminés. C'est le cas par exemple des phosphatases acides prostatiques et tissulaires spécifiques, qui ne partagent que 50 % d'homologie en acides aminés.
Elles sont classées en fonction de leur structure et de leur mobilité électrophorétique.
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