Antibakterielle Wirkstoffe machen sich die Unterschiede zwischen eukaryontischen und bakteriellen Stoffwechselprozessen zunutze. Bei der Untersuchung von Prozessen in eukaryontischen Zellen und Bakterien lassen sich zwei große Unterteilungen vornehmen. Erstens können die Prozesse ähnlich sein, aber mit unterschiedlichen Enzymen ablaufen, zum Beispiel der Aufbau von Peptidketten. Zweitens können in Bakterien ganz andere Prozesse ablaufen, die in Eukaryonten überhaupt nicht vorkommen, wie z. B. die Synthese der bakteriellen Zellwände.
Im nachstehenden Menü sind verschiedene Ebenen aufgeführt, auf denen Antibiotika wirken.
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