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Endopeptidasen sind Enzyme, die Peptide und Polypeptide in kleinere Peptide spalten, indem sie auf Peptidbindungen in der Nähe der Molekülmitte abzielen. Sie sind von den Exopeptidasen abzugrenzen: beide Gruppen sind Peptidasen.
Beispiele für Endopeptidasen sind:
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