Männliche Partner können mit Gardnerella vaginalis kolonisiert sein, und einige Organismen, die Vaginose verursachen, wurden auch im Rektum gefunden, was darauf hindeutet, dass dieses ein Reservoir für vaginale Infektionen darstellen könnte.
Die erste Veränderung in der Pathogenese ist wahrscheinlich ein Anstieg des vaginalen pH-Werts von 4,0 auf 5,5. Dies ist wahrscheinlich auf die Produktion von Aminen durch Gardnerella und Prevotella zurückzuführen.
Es ist unklar, warum nur einige Frauen anfällig sind.
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