Cisaprid hat eine ähnliche Struktur wie Metoclopramid. Es wird schnell resorbiert, erreicht seine Plasmakonzentration innerhalb von 2 Stunden und hat eine Halbwertszeit von 10 Stunden.
Es neigt zu einem erheblichen hepatischen First-Pass-Metabolismus, wobei weniger als die Hälfte den systemischen Kreislauf erreicht. Daher kann eine Leberschädigung die Halbwertszeit des Medikaments verlängern.
Es ist stark proteingebunden, geht kaum in die Muttermilch über und überwindet die Blut-Hirn-Schranke nicht.
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