Bakterien gehören zum Reich der Prokaryoten, in dem es zwei Abteilungen gibt, die Cyanobakterien und die Bakterien.
Die Abteilung Bakterien ist in eine Reihe von Teilen unterteilt. Diese klassifizieren die Bakterien auf der Grundlage ihres mikroskopischen Erscheinungsbildes, einschließlich grampositiv und -negativ, je nach ihren Färbemerkmalen, und dann in Kokken oder Bazillen je nach ihren morphologischen Merkmalen.
Die hier vorgenommene Klassifizierung ist nicht so erschöpfend, wie sie in einigen Texten zu finden ist; in einigen Teilen können weitere Unterteilungen vorgenommen werden.
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