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Die Hemmung der bakteriellen DNA-Funktion kann im Wesentlichen auf zwei Arten erfolgen. Erstens kann die DNA selbst chemisch gebunden werden, wodurch die Fähigkeit zum Ablesen der Sequenz verloren geht oder die Sequenz sogar verändert wird. Zweitens können die für das Ablesen der DNA erforderlichen Enzyme gestört werden.
Ein Beispiel für den ersten Fall ist Nitrofurantoin, der zweite Fall wird durch Nalidixinsäure veranschaulicht.
Ein spezielleres Beispiel ist Metronidazol, das nach seiner Metabolisierung in anaeroben Bakterien wirkt.
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