Ab der vierten Schwangerschaftswoche vergrößert sich der Atrioventrikularkanal und wandert innerhalb des Herzens relativ nach rechts. Er liegt ungefähr in der Koronalebene in Bezug auf den Rest des Körpers. In diesem Stadium ist er inferior, ventral und distal zum primitiven Atrium; dorsal und proximal zum primitiven Ventrikel. An den Rändern der Öffnung wächst das Mesenchym und bildet Grate, die die Furche einengen - die Endokardkissen:
Zu Beginn der sechsten Woche verschmelzen das obere und das untere Endokardkissen zentral miteinander und teilen den Atrioventrikularkanal in eine rechte und eine linke Atrioventrikularöffnung. Die seitlichen Endokardkissen verschmelzen nicht - eine Fusion würde die neu gebildeten atrioventrikulären Öffnungen verletzen -, sondern tragen stattdessen zur Bildung der Atrioventrikularklappen bei - siehe Untermenü.
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