Topoisomerasen sind Enzyme in Bakterien, die in der Lage sind, DNA-Stränge zu brechen, ein anderes DNA-Segment durch den Bruch zu führen und dann den Bruch in einer Weise wieder zu verschließen, die die Supercoiling der zellulären DNA oder die Verknüpfung der einzelnen DNA-Moleküle verändert.
Ein Beispiel für eine Topoisomerase in einer Bakterienzelle ist die DNA-Gyrase, die als einzige der Topoisomerasen in der Lage ist, negative Supercoils in die bakterielle DNA einzubringen.
Die DNA-Gyrase und die Topoisomerase IV sind Angriffspunkte für die Antibiotika der Chinolon-Klasse.
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