Die mit der Parodontitis einhergehende Anhäufung von Zahnbelag führt zu einer Zunahme der Bakterienflora. Es kommt zu einer Verschiebung hin zu gramnegativen Stäbchen, Anaerobiern, Spirochaeten und anderen beweglichen Formen von Bakterien.
In Parodontaltaschen wurden bis zu 300 Bakterienarten identifiziert; aggressive Parodontitis wurde mit den folgenden spezifischen Organismen in Verbindung gebracht:
- Actinobacillus actinomycetemcomitans
- Porphyromonas gingivalis
- Bacteriodes forsythus
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