Si un quiste epidermoide está infectado, primero se debe incidir, drenar y cultivar. Si el drenaje no resuelve la infección, deben iniciarse los antibióticos. Empíricamente, se utiliza un agente antiestafilocócico si se retrasan los cultivos y las sensibilizaciones, ya que éste es el organismo infeccioso más común. La extirpación formal del quiste sólo debe intentarse una vez que la infección y la inflamación se hayan asentado.
Un quiste no infectado puede extirparse con anestesia local. Siempre que esté bien encapsulado, suele ser posible enuclear un quiste grande a través de una pequeña incisión con la retracción adecuada. Se debe intentar mantener la disección a ras de la pared del quiste para evitar dañar las estructuras circundantes. La tensión del contenido del quiste ayuda a la identificación; si el quiste se rompe durante la extirpación, merece la pena intentar suturar el orificio para retener el contenido residual. Por el contrario, cuando se intenta extirpar un quiste muy grande, la aspiración de parte del contenido al principio puede facilitar la salida a través de una pequeña incisión.
Debe extirparse todo el revestimiento del quiste para garantizar que no reaparecerá.
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