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Se cree que se debe a una producción o secreción defectuosa de la hormona liberadora de gonadotrofinas en el hipotálamo.
Las gonadotropinas se ven afectadas solas o en combinación con la GH u otras hormonas hipofisarias.
Una forma de hipogonadismo hipogonadotrófico puede resolverse espontáneamente o tras un tratamiento de 12 meses con hCG (hormona gonadotrófica coriónica humana).
La asociación de la deficiencia de gonadotrofina con la anosmia se denomina síndrome de Kallman.
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