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El canal anal mide unos 4 cm de largo. Está rodeado por el mecanismo del esfínter anal. Comienza en el punto donde la ampolla rectal se estrecha abruptamente, a nivel del músculo puborrectal.
La mitad superior del canal está revestida por mucosa glandular -una continuación de la mucosa rectal- y la mitad inferior por epitelio escamoso estratificado -piel modificada-. El punto en el que se produce este cambio de mucosa glandular a epitelio escamoso es la línea dentada - pectinada.
En la mitad superior del conducto, la mucosa se divide en 6-10 pliegues longitudinales (las columnas de Morgagni), cada uno de los cuales contiene una rama terminal de la arteria y la vena rectales superiores. Estos pliegues son más prominentes donde las venas forman plexos venosos prominentes en los cuadrantes lateral izquierdo, posterior derecho y anterior derecho. En la mitad superior del canal, los linfáticos drenan hacia los ganglios linfáticos pélvicos y abdominales. La mucosa glandular es relativamente insensible en la mitad superior del canal. La mucosa rectal rosada se vuelve de un azul rojizo más oscuro cuando recubre los plexos venosos submucosos.
En la mitad inferior del canal hay drenaje linfático hacia los ganglios inguinales. La piel del canal inferior es muy sensible.
El esfínter anal se compone de tres estructuras:
La contribución más importante a la función del esfínter es el ángulo mantenido por la acción del músculo puborrectal, que forma parte del grupo de los elevadores del ano.
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