Para confirmar un caso de atresia esofágica, se introduce en el esófago, a través de la boca, un catéter de goma blanda de calibre 10 francés. No se puede pasar a más de 10-12 cm de las encías en los casos de atresia. Obsérvese el peligro práctico de que un catéter más pequeño se pase aparentemente, pero en realidad se enrolle en la faringe sin que se note.
Las investigaciones para confirmar el diagnóstico incluyen radiografías de tórax y abdomen. En el caso de una fístula traqueoesofágica, por ejemplo, se observa aire en el estómago y el intestino delgado. No es aconsejable utilizar medios de contraste por el riesgo de aspiración en caso de fístula.
La radiología torácica también puede revelar anomalías cardiacas, y probablemente esté indicado un ecocardiograma, ya que el cirujano necesita saber que la aorta está en el lado correcto.
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