Los rasgos multifactoriales discontinuos dependen del equilibrio de las interacciones génicas. Una vez que un determinado número de genes se ha vuelto hipoactivo, se supera un nivel umbral y el rasgo, normalmente una malformación congénita, se hará evidente. Más allá del umbral, cuanto mayor sea la frecuencia de genes hipoactivos, mayor será la gravedad del rasgo.
Cuanto más lejana sea la relación de parentesco de un individuo afectado, menor será la proporción de genes hipoactivos y menor la probabilidad de que se haya superado el umbral de manifestación del rasgo.
Algunos rasgos multifactoriales muestran un sesgo sexual manifiesto. Esto se explica por un umbral diferente para la aparición de la enfermedad en un solo sexo. Por ejemplo, la estenosis pilórica afecta a 5 de cada 1000 varones y sólo a 1 de cada 1000 mujeres.
Ejemplos comunes de rasgos multifactoriales discontinuos son:
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