El periodo de incubación es muy variable, desde cuestión de días hasta un año. Pueden darse tres presentaciones clínicas diferentes:
- historia de aparición gradual de diarrea leve intermitente con molestias abdominales. A menudo, la diarrea puede ser sanguinolenta y contener mucosidad. La diarrea puede ir acompañada de cefalea, náuseas y anorexia. Puede haber sensibilidad en la fosa ilíaca derecha. Si todo el colon está afectado, habrá sensibilidad abdominal generalizada. Puede palparse un ameboma, que debe diferenciarse de una enfermedad diverticular o de un carcinoma.
- Disentería amebiana aguda: fiebre, malestar, dolor abdominal y diarrea acuosa. A medida que la enfermedad progresa, se acentúan la diarrea sanguinolenta con moco, el tenesmo, la urgencia fecal y el dolor abdominal intenso con calambres.
- colitis fulminante
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