La infección primaria suele producirse en el pulmón dando lugar a un "complejo primario", que es una combinación de:
Si el foco inicial de la infección es el íleon o la amígdala, los ganglios afectados serán los mesentéricos o los cervicales.
En la mayoría de los pacientes el complejo primario cicatriza y se calcifica y la persona se vuelve totalmente asintomática pero se sensibiliza a la tuberculoproteína.
En una minoría de pacientes el proceso de curación puede no ser completo y el paciente puede desarrollar una tuberculosis pulmonar progresiva.
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