Los diagnósticos diferenciales del síndrome de fatiga crónica incluyen:
- depresión; sigue existiendo la creencia popular de que el trastorno se debe a una enfermedad depresiva con fuertes rasgos somáticos
- ansiedad
- Enfermedad de Lyme: en las zonas del país donde la enfermedad de Lyme es endémica, debe excluirse, ya que los síntomas son muy similares.
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