Insuficiencia cardiaca - está causada por la sobrecarga de líquido del ventrículo o ventrículos afectados.
Endocarditis infecciosa - el riesgo de desarrollar esta afección está relacionado con el grado de rugosidad del endocardio por los chorros de sangre a alta velocidad. El riesgo es alto con una comunicación interventricular pequeña, pero muy bajo con una comunicación interauricular grande.
Aumento de la resistencia vascular pulmonar: las derivaciones de izquierda a derecha provocan una presión arterial pulmonar y un flujo sanguíneo pulmonar excesivos. Estas características provocan un daño progresivo del lecho vascular pulmonar con engrosamiento medial de las arterias pulmonares y, posteriormente, cambios intimales que elevan la resistencia vascular pulmonar y limitan el flujo sanguíneo a los pulmones. Los cambios acaban siendo irreversibles aunque se alivie la causa del estrés vascular cerrando la derivación de izquierda a derecha; es el síndrome de Eisenmenger.
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