El componente motor del IX par craneal comienza en la parte rostral del núcleo ambiguo en la formación reticular de la médula. El núcleo recibe información del córtex.
El nervio glosofaríngeo pasa desde el núcleo a través del agujero yugular para descender con el nervio vago lateral a la pared faríngea. El nervio pasa entre los constrictores superior y medio para irrigar el músculo estilofaríngeo y también los constrictores superiores.
Una disfunción de la inervación en el componente motor del nervio glosofaríngeo provoca un control anormal del paladar y la faringe y, por tanto, disfagia.
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