El reflejo de acomodación tiene su entrada aferente en la vía visual primaria, es decir, secuencialmente: retina - nervio óptico - quiasma óptico - tracto óptico - cuerpo geniculado lateral - radiación óptica - córtex visual, área 17.
La vía eferente del reflejo se inicia en el córtex visual, área 19. Desde aquí, las fibras corticocoliculares pasan a los colículos superiores y las fibras corticopretectales pasan a los núcleos pretectales. Desde los colículos superiores, los enlaces interneuronales con el núcleo oculomotor del mesencéfalo permiten la contracción del recto medial y, por tanto, la convergencia. Desde los núcleos pretectales, las fibras pasan al núcleo parasimpático de Edinger Westphal y de ahí a la cavidad orbitaria dentro del nervio oculomotor, donde hacen sinapsis con el ganglio ciliar. Desde el ganglio ciliar, las fibras postganglionares inervan el músculo ciliar para ensanchar el cristalino y las pupilas constrictoras para constreñir el iris.
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