El seno esfenoidal se encuentra en la parte media del cráneo. Drena anteriormente en la cavidad esfenoetmoidal, situada sobre el cornete superior.
El seno esfenoidal está flanqueado por los senos cavernosos, por lo que está estrechamente relacionado con las arterias carótidas internas y los nervios craneales III-VI. Estas relaciones son importantes en la cirugía transfenoidal. El agujero óptico, que contiene el nervio óptico, está estrechamente unido al esfenoides en el ángulo anterior externo, donde se unen el techo y la pared lateral.
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