El pronóstico del carcinoma nasofaríngeo depende más del alcance y la intensidad de la radioterapia recibida que del estadio del diagnóstico; las técnicas modernas de supervoltaje pueden alcanzar tasas de supervivencia a los 5 años del 50% o más, mientras que antes cabía esperar que fueran del orden del 10 - 30%.
La mortalidad suele deberse a la extensión intracraneal, la obstrucción respiratoria, la hemorragia o la caquexia.
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