En la perforación esofágica que causa mediastinitis aguda, los organismos implicados suelen ser los que se encuentran normalmente en la flora oral, especialmente los anaerobios.
La mediastinitis aguda secundaria a una intervención quirúrgica suele afectar a organismos resistentes a los antibióticos utilizados en la profilaxis perioperatoria. Entre ellos se encuentran el Staph. aureus y los bacilos gramnegativos, incluida la Pseudomonas aeruginosa.
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