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Le patient souffrant d'une fistule périanale se plaint d'un écoulement intermittent dans la région périanale, d'une douleur ou d'une gêne dans la région périanale et d'une irritation chronique.
À l'examen, l'ouverture externe de la fissure est généralement visible sur le côté de l'anus. L'ouverture externe peut se présenter sous la forme d'une petite papille de tissu de granulation. Il convient de noter que, bien que ce tableau clinique permette de diagnostiquer une fistule anale, cette lésion cutanée apparemment banale peut souvent être diagnostiquée comme une pustule. L'ouverture interne de la fistule peut être palpée au toucher rectal.
L'examen à l'aide d'un proctoscope peut permettre de visualiser directement l'orifice interne. Il peut être possible de passer une sonde le long de la fistule pour en suivre le trajet.
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