La température centrale est celle qui est censée irriguer les organes vitaux tels que le cerveau et le cœur ; elle est généralement maintenue à 36-37,5 degrés centigrades. Elle est mesurée cliniquement à l'aide de sondes placées dans le rectum, l'œsophage ou le nasopharynx.
En pratique, ce type de mesure étant difficile, la température orale, généralement sublinguale, est enregistrée. La température centrale n'est pas maintenue jusqu'aux couches superficielles du corps, qui sont plus froides et présentent une plus grande plage de variation de température en cas de changement de la température externe. C'est pourquoi la température buccale est généralement inférieure de 0,25 à 0,5 degré centigrade à la température centrale.
La température centrale présente un rythme circadien : elle est la plus basse aux premières heures du matin et, chez les femmes, elle suit un rythme mensuel qui va de pair avec les cycles d'ovulation.
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