Le thiosulfate peut être utilisé dans le traitement de l'empoisonnement au cyanure ; il augmente le taux de détoxification du cyanure en fournissant un substrat à l'enzyme rhodanase, convertissant ainsi le cyanure en thiocyanate. Il n'est pas très efficace lorsqu'il est utilisé seul, car il pénètre les membranes cellulaires plus lentement que le cyanure.
Le thiocyanate de sodium est excrété dans l'urine, ce qui entraîne une diurèse osmotique.
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