Les isoenzymes du système du cytochrome P450 sont ensuite classées en fonction de la similarité de la structure des acides aminés.
si la similarité de séquence est supérieure à 40 %, les enzymes sont regroupées dans une famille désignée par CYP (CYtochrome P450) et un numéro, par exemple CYP 1
si la similarité de séquence est supérieure à 55 %, la sous-famille est regroupée dans un sous-groupe identifié par une lettre majuscule, par exemple CYP 1A
si une isoenzyme individuelle a été identifiée, un numéro supplémentaire lui est attribué, par exemple CYP 1A2.
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