L'issue de la maladie dépend essentiellement du type de lésion, du moment de l'intervention chirurgicale et de la motivation de l'enfant et/ou de ses parents.
Environ un tiers des enfants dont la myéloméningocèle n'a pas été opérée tôt survivront et entreront à l'école cinq ans plus tard. Environ un tiers des survivants seront confinés à un fauteuil roulant ou verront leur mobilité fortement réduite. Environ 85 % d'entre eux seront incontinents et, à l'âge de 16 ans, la fonction des voies rénales supérieures sera gravement compromise. Leur quotient intellectuel peut être limite ou inférieur à la normale.
Les patients qui subissent une intervention chirurgicale précoce peuvent avoir une espérance de vie presque normale.
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