La glucogenèse n'est pas souhaitable lorsqu'une cellule dispose de faibles réserves énergétiques en phosphate nucléotidique. Par conséquent, pour limiter la gluconéogenèse, une concentration élevée d'adénosine mono- ou diphosphate par rapport à l'adénosine triphosphate agit comme un inhibiteur :
- la fructose biphosphatase
- la pyruvate carboxylase
Ces deux enzymes ne sont pas en équilibre et génèrent des flux. Lorsque leur activité est réduite, la glycolyse est la voie préférée de passage des substrats, ce qui est renforcé par l'activation de la 6-phosphofructokinase par l'adénosine monophosphate.
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