Il convient de noter que nombre de ces causes sont énumérées par souci d'exhaustivité et qu'il peut être très rare de voir des aphtes résultant de ces affections.
- maladie gastro-intestinale :
- maladie de Crohn
- colite ulcéreuse
- maladie cœliaque
- maladie rhumatologique :
- maladie de Reiter
- le syndrome de Behcet
- infection :
- virale :
- herpès simplex
- herpès zoster
- bactérienne
- syphilitique
- tuberculeux
- tuberculeux
- virale :
- érythème polymorphe
- auto-infligé
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