En général, les brûlures d'estomac sont le résultat d'un reflux de suc gastrique acide sur une muqueuse œsophagienne sensibilisée par des reflux fréquents. Les brûlures d'estomac peuvent également être provoquées par des substances irritantes neutres ou alcalines, par exemple le reflux du duodénum. Un reflux gastro-œsophagien fréquent pendant un certain temps chez une personne par ailleurs eupeptique provoque des brûlures d'estomac.
Le spasme œsophagien joue également un rôle dans l'apparition de la sensation de brûlures d'estomac. Cependant, si des médicaments anticholinergiques sont utilisés pour supprimer les changements de pression évidents dans le spasme, les brûlures d'estomac se produisent toujours.
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