Il existe de nombreuses théories pour expliquer la pathogenèse de la dyspepsie non ulcéreuse :
- l'excès de sécrétion acide provoque une irritation et une inflammation gastrique et duodénale sans ulcération
- des troubles moteurs :
- gastroparésie idiopathique
- dysmotilité de l'intestin grêle
- reflux gastro-œsophagien
- les causes psychiatriques :
- dépression
- anxiété
- somatisation
- augmentation de la perception viscérale
- intolérance alimentaire
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