Souvent, de grandes plaques de Peyer sont observées lors de l'intervention chirurgicale, ce qui laisse supposer que cette affection pourrait avoir une origine infectieuse. L'hypothèse d'un adénovirus a été avancée. Les plaques de Peyer élargies créent un axe sur lequel le processus d'invagination peut se produire.
Les polypes et le diverticule de Meckel peuvent également prédisposer à cette affection de la même manière que les plaques de Peyer élargies.
L'invagination peut également se produire dans le cas du purpura de Henoch-Schonlein.
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