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La sérotonine est produite à partir du tryptophane alimentaire par l'action de la tryptophane hydroxylase et de la dopa décarboxylase dans les cellules chromaffines et les neurones. Les plaquettes acquièrent de la sérotonine lors de leur passage dans l'intestin, où la concentration locale est élevée.
La voie de dégradation de la sérotonine est importante du point de vue du syndrome carcinoïde. La monoamine oxydase et l'aldéhyde déshydrogénase convertissent la sérotonine en acide 5-hydroxy-indoleacétique - 5HIAA. Le 5HIAA est excrété dans l'urine et constitue donc un moyen rapide d'évaluer le renouvellement de la sérotonine.
La sérotonine est présente dans
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