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Le diagnostic est généralement établi à partir d'un échantillon de selles.
La confirmation par culture d'E. coli O157 au laboratoire de diagnostic prend 24 à 48 heures à compter de la réception de l'échantillon (confirmation locale). En général, cette confirmation est obtenue par les étapes suivantes :
1. Examen de la morphologie coloniale sur des milieux sélectifs (jour 1) ;
2. Réalisation d'un test d'agglutination sur lame sur des colonies individuelles (il s'agit généralement d'un test basé sur un kit E. coli O157) (jour 1) ;
3. Confirmation de l'identité des colonies positives à l'agglutination sur lame en tant qu'E. coli (généralement le jour 2).
Lorsque les trois étapes ont été réalisées, l'isolement d'E. coli O157 à partir de l'échantillon est "confirmé localement".
Cas confirmé : culture STEC positive ou résultat PCR positif à la shiga-toxine de l'unité de référence des bactéries gastro-intestinales (GBRU) du PHE (avec ou sans caractéristiques cliniques, avec ou sans lien épidémiologique avec un cas confirmé).
SHU confirmé lié aux STEC :
Cas probable :
SHU probable lié aux STEC
Lien épidémiologique - lien épidémiologique avec un cas confirmé, en attente des résultats des tests microbiologiques OU diagnostic/laboratoire local PCR positive à la toxine de Shiga, avec ou sans caractéristiques cliniques de STEC
PCR probable - diagnostic/laboratoire local PCR shiga toxine positive MAIS culture négative pour STEC O157, diarrhée sanglante/hospitalisation pour diarrhée aiguë, sans lien épidémiologique avec un cas confirmé
Référence :
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