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Diagnostic

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Le diagnostic est généralement établi à partir d'un échantillon de selles.

Le diagnostic définitif dépend de l'isolement microbiologique et de la caractérisation de l'organisme responsable ou de la mise en évidence d'anticorps dirigés contre le lipopolysaccharide O157.

La confirmation par culture d'E. coli O157 au laboratoire de diagnostic prend 24 à 48 heures à compter de la réception de l'échantillon (confirmation locale). En général, cette confirmation est obtenue par les étapes suivantes :

1. Examen de la morphologie coloniale sur des milieux sélectifs (jour 1) ;

2. Réalisation d'un test d'agglutination sur lame sur des colonies individuelles (il s'agit généralement d'un test basé sur un kit E. coli O157) (jour 1) ;

3. Confirmation de l'identité des colonies positives à l'agglutination sur lame en tant qu'E. coli (généralement le jour 2).

Lorsque les trois étapes ont été réalisées, l'isolement d'E. coli O157 à partir de l'échantillon est "confirmé localement".

Cas confirmé : culture STEC positive ou résultat PCR positif à la shiga-toxine de l'unité de référence des bactéries gastro-intestinales (GBRU) du PHE (avec ou sans caractéristiques cliniques, avec ou sans lien épidémiologique avec un cas confirmé).

SHU confirmé lié aux STEC :

caractéristiques cliniques du SHU ET culture positive de STEC ou résultat positif de la PCR à la shiga-toxine ou confirmation sérologique de STEC par l'unité de référence PHE pour les bactéries gastro-intestinales (GBRU) OU
caractéristiques cliniques du SHU ET résultat positif de la PCR shiga toxine en laboratoire local/de diagnostic

Cas probable :

culture locale O157 positive - diagnostic/laboratoire local positif culture présumée STEC O157 avec ou sans caractéristiques cliniques, avec ou sans lien épidémiologique avec un cas confirmé

SHU probable lié aux STEC

caractéristiques cliniques du SHU, avec ou sans lien épidémiologique avec un cas confirmé, en attente des résultats des tests microbiologiques

Lien épidémiologique - lien épidémiologique avec un cas confirmé, en attente des résultats des tests microbiologiques OU diagnostic/laboratoire local PCR positive à la toxine de Shiga, avec ou sans caractéristiques cliniques de STEC

PCR probable - diagnostic/laboratoire local PCR shiga toxine positive MAIS culture négative pour STEC O157, diarrhée sanglante/hospitalisation pour diarrhée aiguë, sans lien épidémiologique avec un cas confirmé

Référence :

PHE (2019). Recommandations pour la gestion des infections gastro-intestinales par la santé publique.

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