Les bactéries appartiennent au règne des procaryotes, dans lequel il existe deux divisions, les cyanobactéries et les bactéries.
La division Bactéries est classée en une série de parties. Celles-ci classent les bactéries sur la base de leur apparence microscopique, notamment en gram positif et négatif, en fonction de leurs caractéristiques de coloration, puis en cocci ou bacille en fonction de leurs caractéristiques morphologiques.
La classification adoptée ici n'est pas aussi exhaustive que celle que l'on peut trouver dans certains textes ; il peut y avoir d'autres divisions dans certaines parties.
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