Le pronostic dépend principalement de l'étiologie sous-jacente ; un mauvais pronostic est observé dans les cas suivants :
- anomalies structurelles
- asphyxie grave à la naissance
- hémorragie intraventriculaire grave
- hypocalcémie précoce
Le pronostic est également aggravé dans les cas suivants
- début précoce
- crises prolongées et fréquentes
- mauvaise réponse aux médicaments
- récurrence sur plusieurs jours
- accouchement prématuré ; faible poids à la naissance
- signes neurologiques établis
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