- les trisomies, en particulier la trisomie 21, ainsi que les trisomies 18 et 13 (bien qu'un taux d'AFP faible ne soit pas aussi précis pour prédire la trisomie 21 qu'un taux d'AFP élevé pour prédire le spina bifida).
- un faible taux d'AFP peut être observé chez les mères souffrant de diabète, sans implication de trisomie.
- surestimation de la gestation
- poids maternel supérieur à la moyenne
- avortement spontané
- certaines grossesses molaires
- grossesse non viable
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