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L'échographie Doppler peut être utilisée pour évaluer la perméabilité des vaisseaux intracrâniens et extracrâniens.
On utilise soit un système à ondes continues, soit un système à impulsions. Ce dernier peut être interfacé avec un balayage en mode B pour fournir un balayage duplex. Ce dernier peut être interfacé avec un balayage en mode B pour fournir un balayage duplex, qui fournit des informations supplémentaires à l'onde continue concernant la morphologie de la plaque. Le doppler codé en couleur est également disponible ; le flux qui s'éloigne du transducteur est bleu, celui qui s'en rapproche est rouge, et la vitesse du flux est proportionnelle à la saturation de la couleur. Il est particulièrement utile en cas de pseudo-occlusion - par exemple, une sténose carotidienne de haut degré peut être interprétée à tort comme une occlusion totale avec les méthodes standard.
Les fréquences de 5 à 10 MHz sont typiques de l'échographie extracrânienne. Une fréquence plus basse, 2 MHz, est plus habituelle pour l'échographie intracrânienne.
L'un des principaux inconvénients de l'échographie Doppler dans son ensemble est la dépendance à l'égard de l'opérateur. Il faut au moins 6 mois de formation avant de pouvoir obtenir des données fiables.
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