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Le septum interventriculaire est la paroi du cœur intermédiaire entre les ventricules droit et gauche. Ses marques de surface correspondent aux sillons interventriculaires antérieur et postérieur. Il s'étend obliquement vers la gauche et légèrement en dessous, de postérieur à antérieur. En raison de cette angulation, le ventricule droit a tendance à se situer en avant et le ventricule gauche en arrière.
Sur la majeure partie de sa surface, le septum est aussi musclé que le ventricule gauche. Il a tendance à s'enfoncer dans la chambre du ventricule droit, ce qui produit une concavité du côté du ventricule gauche. Plus près de l'orifice de la valve aortique, sous les marges des feuillets droit et postérieur, le septum devient plus fin et plus fibreux. Cette région est appelée pars membranacea septi, ou partie membraneuse du septum interventriculaire. Elle est de forme ovale.
Les parties musculaire et membraneuse de la cloison interventriculaire ont des origines développementales différentes. La partie membraneuse du septum est le site le plus fréquent des malformations septales ventriculaires qui sont généralement congénitales.
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