Le traitement est de soutien ; il comprend la prise en charge de l'insuffisance cardiaque avec de la digoxine, des diurétiques et de l'oxygène.
Dans 20 % des cas, le patient ne se rétablit pas complètement. Certains évoluent vers une fibroélastose endocardique et d'autres meurent.
En particulier, la myocardite à Coxsackie B chez les nouveau-nés a un taux de mortalité de 80 %.
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