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Il est clair qu'avec un diagnostic à vie comme celui du syndrome de Down, il est important de confirmer l'impression clinique par une analyse chromosomique ; cela a certaines implications pour les parents si cela révèle une translocation chromosomique.
Tous les nouveau-nés atteints du syndrome de Down doivent faire l'objet d'un dépistage des cardiopathies congénitales, qui comprend un ECG, une échocardiographie et une radiographie thoracique.
Sauf indication clinique, il n'est pas nécessaire de procéder à des examens complémentaires. Les tests de dépistage de l'hypothyroïdie congénitale et de la phénylcétonurie doivent être effectués conformément au protocole local. Ces tests peuvent être répétés plus tard dans la vie par les équipes de santé communautaire.
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