En l'absence de traitement pour une transposition complète, plus de 90 % des nourrissons meurent dans l'année qui suit.
L'amélioration des techniques chirurgicales a permis à de nombreux patients de survivre jusqu'à l'âge adulte.
L'incidence des arythmies auriculaires et du dysfonctionnement du ventricule droit est plus élevée chez les patients opérés pendant l'enfance et qui survivent jusqu'à l'âge adulte.
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