Il s'agit notamment des éléments suivants
- les dépenses
- la non-réponse et les abandons, qui peuvent entraîner des biais
- difficulté à maintenir des techniques constantes dans le temps
- lenteur de l'accumulation des résultats
- nécessité de tester des hypothèses spécifiques
- ne peut généralement pas tester de nouvelles hypothèses - mais de nombreux chercheurs prélèvent, par exemple, un excès de sang dans les échantillons, qui est ensuite stocké
- ne convient pas aux maladies rares
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