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La thrombose peut se développer n'importe où dans la circulation veineuse cérébrale, chaque site étant associé à des présentations particulières qui peuvent être distinguées cliniquement.
Le sang passe des capillaires cérébraux aux veines corticales qui se déversent dans les sinus veineux. Ceux-ci sont tapissés d'endothélium et se situent entre les couches de la dure-mère. Les sinus veineux jouent un rôle crucial dans l'absorption du LCR : les médiateurs clés de cette action sont les villosités arachnoïdiennes qui pénètrent dans le sinus sagittal. Elles communiquent avec les veines méningées et par des veines émissaires avec les veines du cuir chevelu.
Deux types de thromboses sont couramment reconnus :
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