Les aspects histologiques du Kuru sont similaires à ceux de la maladie de Creutzfeldt-Jakob, avec une triade de vacuolisation spongiforme, de perte neuronale et de prolifération astrocytaire.
Ces changements affectent toutefois principalement le striatum et le cervelet. En outre, on observe des plaques de Kuru d'amyloïde contenant une protéine prion de 27 kdaltons, que l'on trouve dans le cervelet dans 60 % des cas.
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