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Dans le syndrome de Guillain-Barre, la réponse des lymphocytes T suppresseurs est réduite, ce qui suggère une réaction immunologique à médiation cellulaire dirigée contre les nerfs périphériques. Des anticorps sériques dirigés contre les composants de la myéline sont parfois détectés.
Les lésions nerveuses sont segmentaires. Les lymphocytes infiltrent les racines nerveuses et libèrent des substances cytotoxiques qui endommagent les cellules de Schwann et la myéline. La myéline est éliminée par les macrophages. Si l'axone est endommagé, la cellule nerveuse meurt et la régénération devient impossible.
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