La 6-phosphofructokinase est inhibée par :
- l'ATP ; par conséquent, une cellule chargée en énergie peut minimiser la production d'énergie par la glycolyse ; l'AMP a l'effet inverse
- une faible concentration de glucose dans le sang ; par conséquent, la glycolyse est réduite lorsque le substrat est peu abondant, ce qui permet de le conserver pour les tissus dans lesquels il constitue une source de carburant obligatoire
- acidité ; il existe donc un moyen de réduire la production glycolytique d'acide lactique en excès
- l'acide citrique ; il y a donc une rétroaction négative du cycle de l'acide tricarboxylique comme moyen de réduire l'approvisionnement en précurseurs biosynthétiques lorsqu'ils sont abondants.
Par ailleurs, la 6-phosphofructokinase est stimulée par :
- le fructose-6-phosphate ; par conséquent, un excès de substrat peut accélérer son utilisation - feedforward positif
- le fructose-2,6-biphosphate ; ainsi, le produit de la réaction peut augmenter sa propre production - rétroaction positive
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