La chaîne de transport d'électrons et la phosphorylation oxydative sont étroitement liées. Tous les complexes enzymatiques sont proches de l'équilibre. Par conséquent, le taux de production d'ATP, ou inversement le taux de production de NADH ou de FADH2 à partir de l'ATP, dépend du gradient de concentration entre le substrat et le produit. Ainsi, une activité accrue du cycle de l'acide tricarboxylique en réponse à de faibles réserves énergétiques cellulaires augmentera simultanément le taux d'activité de la chaîne de transfert d'électrons et de la phosphorylation oxydative.
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